La visite s'effectue en suivant le cycle de l'eau. Le public suit le voyage d'une goutte d'eau depuis les eaux souterraines jusqu'à son retour à la mer. Le visiteur découvre ainsi : les eaux souterraines (la grotte de San Lui Potose au Mexique), les eaux rapides des torrents (Asie, Amérique, Afrique), les eaux calmes des fleuves et des rivières (Amazonie, Asie du Sud-Est, Australie, Nouvelle Guinée, Afrique équatoriale, selva sud-américaine), les eaux dites stagnantes des lacs et des étangs (la faune européenne, les lacs africains), les eaux saumâtres des estuaires (les crocodiles du Nil) et les eaux des mers et des océans (les récifs coralliens, le bassin des requins).

Historique
1990 : Inauguration avec un ensemble d'aquariums (500 m² de présentation), un restaurant et une boutique.
1991 : Arrivée des premières tortues de Floride. Édition des premiers documents pédagogiques et accueil des premiers scolaires. Restauration des murs d'enceinte datant du XVIIIe siècle. Aménagement d'une salle d'élevage de 42 bassins et accueil des premiers requins dans cette même salle.
1992 : Installation de panneaux pédagogiques et de panneaux en braille. Création de la salle des bassins tactiles.
1993 : Ouverture de la salle des lacs africains. Arrivée de jeunes crocodiles.
1994 : Arrivée de pythons.
1995 : Création du bassin aux requins et présentation au public de ces animaux.
1996 : Aménagement d'un espace de jeu pour enfants.
1997 : Création d'un bassin pour périophtalmes, d'un enclos pour ragondins et d'un biorama composé de 10 aquariums.
1998 : Inauguration d'un enclos en extérieur pour chèvres naines et d'une seconde salle de restauration.
1999 : Réaménagement de l'accueil des visiteurs.
2000 : L'Aquarium Les Naïades devient le Parc Les Naïades. Création d'un bassin récifal et d'un enclos pour faisans.
2001 : Inauguration d'une mini-ferme pédagogique.
2002 : Aménagement du parc paysager et création d'un sentier botanique.

La visite commence par l'observation des coulisses. De nombreux petits aquariums installés dans une pièce spécifique sont visibles à travers un hublot.

Le bassin 1 représente les eaux souterraines dans les grottes. Il abrite des characins, poissons cavernicoles aveugles et dépigmentés. Les bassins 2, 3 et 4 représentent les eaux rapides. Les poissons rhéophiles (qui aiment le courant) ne nagent qu'occasionnellement en pleine eau. Ils ont un corps hydrodynamique, une peau lisse et une vessie natatoire (poche de gaz) atrophiée. Ils sont donc plus lourds que l'eau. Toutes ces particularités leur permettent de ne pas être emportés par le courant. Le bassin 5 abrite des tortues de Floride, animaux recueillis aux Naïades.

Le bassin 6 représente la partie basse du torrent ou crique qui abrite des poissons ovovivipares. Il y a peu de profondeur d'eau et les fonds sont riches en alluvions. Cet aquaterrarium permet de présenter également des plantes aquatiques, subaquatiques, terrestres et aériennes. Le bassin 7 représente les eaux calmes et plus particulièrement l'Amazonie avec un banc de piranhas. Ce bassin tout en hauteur a un volume de 8 000 litres d'eau et est tout à fait impressionnant. Le bassin 8 représente les eaux calmes d'Asie du Sud-Est : poissons-requins, labéos, requins d'argent, loches clowns... Le bassin 9 représente les eaux calmes d'Australie et de Nouvelle Guinée et abrite des poissons arc-en-ciel. Le bassin 10 représente les eaux calmes de l'Afrique équatoriale et abrite des feux de position, des lifalilis, des poissons couteaux, des poissons papillons ou pantodons, des poissons chats ou synodontes...

Le bassin 11 représente les eaux calmes de la selva sud-américaine. Les oscars, qui s'y trouvent, sont impressionnants. Le bassin 12 représente les eaux calmes d'Amérique centrale. Dans cette région, il n'y a que peu ou pas de plantes dans les fonds des fleuves et des rivières. L'oxygène est alors en partie apportée par des plantes de surface. Des cichlidés vivent dans cet aquarium. Le bassin 14 représente les eaux calmes et abrite des poissons caractéristiques de ces eaux : les discus. Quelques espèces cohabitent avec ces derniers : néons, poissons hachette... Le bassin 15 représente les eaux dites stagnantes du lac Tanganyika et abrite des cichlidés queue de lyre, des cichlidés citron, des cichlidés julido et des frontosas.

Le bassin 16 est un bassin tactile où évoluent des carpes, des gardons, des tanches, des carpes Koï et des esturgeons. Un décor rocheux a été aménagé en arrière plan. Des tortues terrestres et des iguanes verts vivent dans deux terrariums en face du bassin tactile. Le bassin 18 héberge des hippocampes. C'est une des nouveautés 2003. Le bassin 19 présente des périophtalmes. Ce sont des poissons marcheurs. Ces drôles de poissons habitent essentiellement dans les mangroves. Ils ont la particularité de pouvoir sortir hors de l'eau pour marcher, voire grimper ! Ils n'ont cependant pas de poumons. Lorsqu'ils sont hors de l'eau, ils sont tributaires de l'oxygène contenu dans l'eau qu'ils stockent au niveau d'une poche à proximité de leurs branchies. Le terrarium 20 abrite un python royal. Il est nourri une fois par semaine avec des souris d'élevage.

Le bassin 21 représente les eaux dites stagnantes du lac Malawi et abrite des cichlidés. Il existe trois grands lacs en Afrique : le Tanganyika, le Victoria et le Malawi. Ces lacs sont à eux seuls de véritables écosystèmes souvent apparentés à la mer. L'enclos 22 abrite deux jeunes crocodiles du Nil arrivés aux Naïades en 1993. Ils se nomment Bébé et Dundee. Leur enclos est accidenté avec de nombreux rochers et pierres. Un petit bassin sombre complète la structure. La végétation est également présente. Le terrarium 23 abrite un python sebae nommé Bischoff. Il a été trouvé en 1995 à Bischoffsheim, petit village alsacien. Son menu est composé de rats, de cochons d'Inde et de lapins. Le bassin 24 était initialement occupé par des ragondins. Ces animaux ont été transférés dans un nouvel enclos extérieur, plus vaste.

Les bassins 25 à 34 représentent les eaux froides avec entre autres des perches soleil dans le bassin 26 ou des bouvières dans le bassin 30. Certains de ces bassins abritent également des fiches pédagogiques et des squelettes de poissons. Le bassin 34 présente le système de filtration utilisé aux Naïades. Chaque bassin a une température différente en fonction du milieu d'origine des animaux présentés. Un bassin n'est jamais vidé une fois rempli, un équilibre biologique s'installe et il convient de le préserver. L'eau du bassin est entraînée en sortie vers un bac de décantation puis à travers un bac de filtration. Une partie de cette eau passe sur des rayons ultraviolets qui ont un effet bactéricide. L'eau purifiée retourne dans le bassin. Le renouvellement de l'eau, à raison de 1/3 du volume par mois, s'effectue grâce à un système de goutte à goutte. Le goutte à goutte compense ainsi la perte en eau suite à son évaporation.

Le bassin 35 représente l'eau des mers et des océans grâce à un récif corallien. Il est donc appelé le bac récifal. En Alsace, aucune eau de mer naturelle n'est disponible, il faut donc fabriquer sur place un substitut avec des sels spéciaux. Le bassin 36 représente également l'eau des mers et des océans et abrite des espèces de poissons caractéristiques des récifs coralliens : demoiselle zèbre, demoiselle citron, demoiselle chocolat, poisson papillon, poisson chirurgien bleu, poisson vanille-fraise... Ces poissons se nourrissent des coraux et des animaux qui vivent au sein du récif corallien. Ils ont donc été volontairement présentés hors du bac récifal.

Le bassin 37 représente l'eau des mers et des océans. Cet aquarium qui termine la visite contient près de 100 000 litres d'eau de mer reconstituée et est appelé le bassin des requins. Les vitres épaisses (4 cm) pèsent près d'une tonne et demie chacune. Les espèces présentées sont les suivantes : requin nourrice, requin pointe noire (un couple), poisson pilote ou poisson ventouse, poisson ballon, rascasse volante ou poisson scorpion, murène (2 léopards et une verte), poisson chauve-souris ou platax, mérou rouge, mérou vert, baliste clown, poisson vache... Les requins et les murènes sont nourris de filets de poissons et d'encornets ; les autres poissons se nourrissent de moules et d'éperlans.

Aux Naïades, les poissons sont nourris de poissons frais, de moules, de vers de vase, d'artémias, de petits pois, d'épinards, puis le jour suivant de paillettes spéciales pour faune aquatique. Certaines espèces possèdent un régime spécial : poissons frais et viande rouge pour les piranhas ; viande rouge, moules, poisson, salade pour les tortues ; cuisses de poulet, viande rouge, coeur de boeuf et poisson pour les crocodiles ; principalement des souris pour les pythons ; légumes, fruits et maïs pour les ragondins. Toutes les plantes des aquariums sont naturelles, qu'elles soient terrestres ou aquatiques. Les décors sont faits de mousse polyuréthane sculptée, résinée (résine alimentaire) enduite de colorants naturels.

Une ferme pédagogique a été récemment ajoutée à l'aquarium. Elle abrite un certain nombre d'espèces domestiques et en particulier des ânes, des chèvres naines, une basse-cour... Des aires de jeux et de pique-nique complètent les structures extérieures.

En conclusion, Les Naïades présentent un important aquarium abritant de nombreuses espèces. Ce parc s'est diversifié au cours de son évolution et offre également à présent la possibilité d'observer d'autres espèces telles que reptiles, petits mammifères, animaux domestiques et autres oiseaux.